Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ddit3P35639 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ddit3P35639 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms