Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Vwa7-201ENSMUST00000007245 4313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Apoc1P34928 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Apoc1P34928 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms