Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Pde6aP27664 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms