Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
H2afxP27661 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms