Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CftrP26361 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CftrP26361 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 AC123619.2-202ENSMUST00000225097 1568 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CftrP26361 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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