Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ms4a2P20490 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ms4a2P20490 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms