Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
P18530 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
P18530 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18530 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18530 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18530 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
P18530 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
P18530 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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