Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm29500-201ENSMUST00000185992 1344 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 9330118I20Rik-201ENSMUST00000203390 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Irf2-209ENSMUST00000210218 535 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 CT010431.1-201ENSMUST00000221249 1080 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Hoxb1P17919 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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