Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Vpreb2P13373 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC8.81□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms