Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
Vpreb1P13372 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms