Protein–RNA interactions for Protein: P09225

Lta, Lymphotoxin-alpha, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtaP09225 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LtaP09225 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LtaP09225 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
LtaP09225 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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