Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Me1P06801 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Me1P06801 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Me1P06801 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms