Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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Psmb10O35955 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Psmb10O35955 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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