Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
FxnO35943 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
FxnO35943 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms