Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Stag2O35638 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Stag2O35638 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Stag2O35638 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms