Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Ebi3O35228 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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