Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Kif1cO35071 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Kif1cO35071 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms