Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-Q1O19441 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-Q1O19441 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms