Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm21310J3QQ23 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm21310J3QQ23 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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Gm21310J3QQ23 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
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