Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP9

Fam240a, Family with sequence similarity 240 member A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam240aJ3QNP9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.4□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Smad9-201ENSMUST00000029371 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Fam240aJ3QNP9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms