Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
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Zfp870J3QMA4 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zfp870J3QMA4 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
Zfp870J3QMA4 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Zfp870J3QMA4 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
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Zfp870J3QMA4 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
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Zfp870J3QMA4 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Zfp870J3QMA4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms