Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
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Gm21818J3KMS6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Gm21818J3KMS6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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