Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Taf4bG5E8Z2 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
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Taf4bG5E8Z2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Taf4bG5E8Z2 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
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