Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Atf6F6VAN0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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