Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ccdc71lE9Q4T4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ccdc71lE9Q4T4 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms