Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3H4

Susd1, Sushi domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 752 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd1E9Q3H4 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Susd1E9Q3H4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd1E9Q3H4 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd1E9Q3H4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Susd1E9Q3H4 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Susd1E9Q3H4 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms