Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Trappc8E9PWG2 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms