Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Syde2E9PUP1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms