Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm45501-201ENSMUST00000211468 2526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Col6a2-201ENSMUST00000001181 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Samd1D3YXK1 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Gm20089-201ENSMUST00000192391 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Samd1D3YXK1 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms