Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Cttnbp2B9EJA2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Cttnbp2B9EJA2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms