Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cspp1B2RX88 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms