Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

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Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Tspan32-203ENSMUST00000082008 1587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clrn2B2RVW2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clrn2B2RVW2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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