Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Rd3lB2RV38 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Rd3lB2RV38 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms