Protein–RNA interactions for Protein: B2RPU8

Zbed5, MCG130675, mousemouse

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Length 756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed5B2RPU8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Zbed5B2RPU8 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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