Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Prr16A3KMN5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms