Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mettl1-202ENSMUST00000120542 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ambra1A2AH22 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ambra1A2AH22 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms