Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ccdc163A2AGD7 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ccdc163A2AGD7 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms