Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Frmpd4A2AFR3 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms