Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rbbp8nlA2ABX0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms