Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Gm35135-201ENSMUST00000219885 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC163354.2-201ENSMUST00000221741 649 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC117656.3-205ENSMUST00000224606 1205 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Cryab-201ENSMUST00000034562 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC125487.2-201ENSMUST00000219810 1300 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm3238W4VSP7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Klrb1a-202ENSMUST00000171306 989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm20528-202ENSMUST00000174821 802 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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Gm3238W4VSP7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Klre1-201ENSMUST00000053708 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Lyrm2-201ENSMUST00000062802 465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Gm3238W4VSP7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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