Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Top3bQ9Z321 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Top3bQ9Z321 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms