Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hdac6Q9Z2V5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 4930539M17Rik-201ENSMUST00000194792 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Hdac6Q9Z2V5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hdac6Q9Z2V5 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms