Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Crlf3Q9Z2L7 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms