Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Psmb3Q9R1P1 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Psmb3Q9R1P1 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms