Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1I1

Chst4, Carbohydrate sulfotransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst4Q9R1I1 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Chst4Q9R1I1 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Chst4Q9R1I1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Chst4Q9R1I1 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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