Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Limd1Q9QXD8 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms