Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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Col5a3Q9JLI2 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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