Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm9816-201ENSMUST00000122292 1414 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
CtsmQ9JL96 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
CtsmQ9JL96 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms