Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL19

Ncoa6, Nuclear receptor coactivator 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa6Q9JL19 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ncoa6Q9JL19 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ncoa6Q9JL19 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ncoa6Q9JL19 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
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Ncoa6Q9JL19 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ncoa6Q9JL19 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ncoa6Q9JL19 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ncoa6Q9JL19 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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Ncoa6Q9JL19 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ncoa6Q9JL19 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms