Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Cst8-202ENSMUST00000109947 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm6121-201ENSMUST00000119231 924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Platr28-201ENSMUST00000133824 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Scgb1c1-201ENSMUST00000035300 455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Olfr829-201ENSMUST00000058411 966 ntAPPRIS P2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ms4a4bQ9ES61 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms